在后世的合众国教科书中，长崎事变一直被冠以长崎大屠杀之类的名字，且被定义为是日本德川幕府针对合众国自由守法商民的迫害和屠戮，但真正了解这段历史的人却知道，并没有这么简单，比如这场被称之为大屠杀的事变中，中国籍商人的死亡人数只有三十五人，如果加上伪装成中国商人的广南、暹罗商人及被针对的华人群体，也不过造成了五百人的伤亡。
实际上这种被冠以大屠杀的事件能上教科书，更多的是合众国的海外军事行动能得到国民的支持，因此常常把一些死亡数量很少的事件称之为屠杀，以更好的干预海外局势，对于这一点，欧洲人习以为常，比如后世历史上著名的波士顿大屠杀，只死了五个人。
长崎事变爆发后，并不是日本乱民包围长崎城进行大规模的屠杀，相反，魏柏年很快从唐津藩武士的嘴里知道，这次事件并非是德川幕府策划的，主要依据在于，除了唐津藩，九州各藩都没有进行动员。
搞清楚状况之后，魏柏年当晚便是以中国公使的身份对所有的中国商船进行军事管制，并且授权水手们强征所有的日本商船和水手，而对于其他外籍商船则予以放行，而在此之前，魏柏年已经向大本营和济州岛的北洋战区求援。
当晚后半夜，魏柏年亲率一支八百人的武装队冲入了长崎城，控制了主要街道和长崎奉行所，宣布对这座城市进行军事管制，然后命令城中所有的中国人和华人向码头撤离，而码头的船只则将其先带到长崎港最近的五岛暂时安置，第二天华人自卫队和中国商人志愿队组建，控制长崎的武装力量达到了四千人，虽然枪械不足，但大炮却很多，直接放在路口装满霰弹阻击。
日本的暴民很快被镇压，唐津藩与周边的两个谱代大名重新组织了两千五百人的军队围攻，但遭遇了失败，长崎事变发生的十天后，北洋舰队就赶到了，可惜，北洋舰队指挥官只带来了战舰，没有带陆战队，因为他得到的情报只是长崎发生骚乱，商船需要护卫。
但舰船上还是有随船陆战队的，舰队里的水手也不缺少武器，北洋舰队司令官宋罗峰派遣一千人上岸支援魏柏年，魏柏年是宋罗峰的堂外甥，配合倒也得当。
中国人控制长崎城的消息很快传开，九州和本州的一些大名开始集结部队汇聚而来，但也有一些大名，比如岛津藩故意找借口迟缓出兵。
大本营，元老会议室，元老们因为突发的长崎事变已经被紧急召集起来，这一次元老会议中多了阿海和马东来两位年轻的角色，李明勋今年初
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