虽然李君华是有些被动应对藏地的挑战，但他做事一丝不苟的性格还是发挥了作用，帝国的理藩院为其提供了相当全面的资料，让其重新审视藏地的情况。
来自天山北路的固始汗进入藏地协助黄教夺取了藏地大片土地的控制权，但是固始汗也并非只是为了护教而已，他很快迁移麾下部落，在藏地建立了和硕特汗国，成为目前帝国藩属体系之中与土尔扈特汗国唯二的独立汗国。
但是在藏地，上人为首的黄教势力实在是根深蒂固，即便是拥有绝对的实力和高超的政治智慧，固始汗仍然无法把黄教势力从汗国中枢驱逐，因此建立了政教分离的体制，上人被尊奉为黄教的最高领袖，而藏地的军政大权则掌握在汗王手中，实际上，和硕特直接控制的土地位于青海，而在前藏、后藏等地，固始汗进行了妥协，派遣一位第巴以上人总管的身份执掌黄教辖地内的政权。
那个时代，黄教向固始汗的世俗政权屈服，但没有人有怨言，毕竟二十出头的上人是冉冉升起的朝阳，而六十多岁的固始汗则已经落日余晖了。
固始汗去世的时候，上人已经是春秋鼎盛的年纪，他没有挑战固始汗确立的体制，而是循序渐进的瓦解，首先就是在和硕特汗王继承的问题上做文章，青海是和硕特汗国的核心，但汗**队主力却在达木，上人没有推举新的大汗，而是委任了固始汗的两个儿子分别掌管军队和牧地，汗王之位空虚了数年后，上人找到了一个合适的人物，也就是现在的大汗朋楚克。
他对黄教是虔诚的，对上人也有着充足的尊重，所以他被推举为了大汗，当然更大的原因在于朋楚克对政治不大感兴趣，在继位之后的很长时间里任凭上人夺取政权。
而核心就是第巴这一重要的职位，从第巴必须由汗王委任，逐渐转为了上人委任，而现在的第巴桑结嘉措很有可能是上人的私生子，是被其视为眼睛一样贵重的存在，由其一手栽培，成长为第巴的。
朋楚克还是在帝国的支持和授意下才略微觉醒，着意保护原本属于自己的权柄，比如在上人第一次委任桑结嘉措作为第巴的时候，朋楚克选择了沉默，在得不到他的支持的情况下，上人只能选择财务总管暂时接手了三年，才让桑结嘉措接任了。
但是不管怎么说，在汗王世俗政权与黄教教权的争夺之中，朋楚克已经完全处于了下风，汗王对前后藏已经失去了控制力，桑结嘉措不仅要求辖地内的其他教派强制性改宗，甚至有胆量把蒙古部众直接吞并为寺庙的私产。
而和
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